Genetyka i genomika mikroorganizmów

Ukończony kurs mikrobiologii ogólnej.

Godziny kontaktowe (z udziałem nauczyciela akademickiego):

Wykłady 15

Laboratorium 15

Łączna liczba godzin z udziałem nauczyciela akademickiego 30

Godziny nie kontaktowe (praca własna studenta)

Przygotowanie się studenta do zajęć laboratoryjnych 10

Przygotowanie się studenta do zaliczeń 15

Studiowanie przez studenta literatury przedmiotu 5

Łączna liczba godzin niekontaktowych 30

Łączna liczba punktów ECTS za moduł 5

Na podstawie Uchwały Senatu UMCS Nr XXV-8.10/21 z dnia 26 maja 2021 r. tj. od cyklu kształcenia 2021/2022:

Zaliczenie pisemne - W1, W2, W3

Wykonanie doświadczeń - U1

Aktywność na zajęciach laboratoryjnych - K1

Wykłady: struktura i organizacja genomów prokariotycznych: chromosomy i plazmidy, zmienność i plastyczność genomów mikroorganizmów. Mobilom bakteryjny: typy replikonów pozachromosomalnych, bakteriofagi. Zastosowania bakteryjnego mobilomu w biotechnologii: wektory DNA, fagoterapia, typowanie fagowe. Horyzontalny transfer genów: transformacja, koniugacja, transdukcja. Bariery horyzontalnego transferu genów: systemy restrykcji i modyfikacji oraz CRISPR. Rola ruchomych elementów genetycznych w rozprzestrzenianiu się oporności na leki przeciwbakteryjne. Metody stosowane w badaniu składu i funkcji mikrobiomów różnych środowisk. Metagenomika bakterii i jej znaczenie w identyfikacji nowych genów i szlaków metabolicznych.

Ćwiczenia laboratoryjne: Identyfikacja plazmidów metodą Eckhardta; elektroforeza w pulsacyjnym polu elektrycznym (PFGE); identyfikacja w genomach bakterii polimorfizmów związanych z sekwencjami powtórzonymi (metoda ERIC-PCR, BOX-PCR i rep-PCR)

Terrence Brown, Genomy, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2019

Terrence Brown Genomy, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2025

Jadwiga Baj, Zdzisław Markiewicz, Biologia molekularna bakterii, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2016

Na podstawie Uchwały Senatu UMCS Nr XXV-8.10/21 z dnia 26 maja 2021 r. tj. od cyklu kształcenia 2021/2022

WIEDZA: Absolwent zna i rozumie

W1. strukturę i funkcje genomu bakteryjnego i pozachromosomalnych elementów genetycznych - K_W04

W2. podstawowe i zaawansowane techniki badawcze stosowane w badaniach genomów bakteryjnych - K_W07

W3. mechanizmy horyzontalnego transferu genów oraz ich znacznie w biotechnologii i medycynie K_W06

UMIEJĘTNOŚCI: Absolwent potrafi

U1. przeprowadzić analizy genomu bakteryjnego oraz pozachromosomalnego DNA różnymi technikami elektroforetycznymi - K_U03; K_U04;

U2. Absolwent potrafi komunikować się z otoczeniem z użyciem specjalistycznej terminologii z zakresu genetyki i genomiki mikroorganizmów - K_U08

KOMPETENCJE SPOŁECZNE:Absolwent jest gotów do

K1. krytycznej oceny posiadanej wiedzy i odbieranych treści w zakresie genetyki i genomiki mikroorganizmów - K_K01