Podstawy diagnostyki i lekooporności mikroorganizmów

Student powinien posiadać podstawową wiedzę z mikrobiologii

Student powinien posiadać podstawowe umiejętności pracy w laboratorium mikrobiologicznym.

Godziny kontaktowe (z udziałem nauczyciela akademickiego):

Wykład 15

Laboratorium 15

Łączna liczba godzin z udziałem nauczyciela akademickiego 30

Godziny nie kontaktowe (praca własna studenta)

Przygotowanie się studenta do zajęć laboratoryjnych 15

Przygotowanie się studenta do zaliczeń i/lub egzaminu 10

Studiowanie przez studenta literatury przedmiotu 5

Łączna liczba godzin niekontaktowych 30

Łączna liczba punktów ECTS za moduł 3

Na podstawie Uchwały Senatu UMCS Nr XXV-8.10/21 z dnia 26 maja 2021 r. tj. od cyklu kształcenia 2021/2022:

Zaliczenie pisemne na ocenę W1-W3

Kolokwium W1, U1, U4

Wykonanie doświadczeń U1, U3

Aktywność na zajęciach K1

Wykład ma na celu zapoznanie się z klasyfikacją i mechanizmami działania antybiotyków oraz metodami stosowanymi do oznaczania wrażliwości na antybiotyki. Omówione zostaną mechanizmy oporności drobnoustrojów na środki przeciwdrobnoustrojowe i problem wielolekooporności bakterii (patogeny alarmowe). Zastosowanie metod molekularnych do typowania bakterii oraz wykrywania genów oporności na antybiotyki i kodujących czynniki wirulencji. Zapoznanie z metodami serologicznymi w diagnostyce bakterii, drożdżaków i grzybów chorobotwórczych.

Laboratorium

Oznaczanie wrażliwości na antybiotyki (metoda dyfuzyjno-krążkowa, oznaczanie MIC, E-testy), metody fenotypowe określania mechanizmów lekooporności. Wykrywanie genów kodujących czynniki wirulencji (antygenów powierzchniowych i toksyn) metodą PCR; typowanie szczepów techniką BOX-PCR. Serotypowanie wybranych drobnoustrojów z zastosowaniem testów lateksowych i surowic odpornościowych.

1. Baj J., Markiewicz Z. Biologia molekularna bakterii, PWN 2023

2. Markiewicz Z. Bakterie antybiotyki lekooporność, PWN 2024

3. Boswell T., Irving W. Mikrobiologia medyczna krótkie wykłady, PWN 2022

4. Materiały dostarczone przez prowadzącego zajęcia.

Na podstawie Uchwały Senatu UMCS Nr XXV-8.10/21 z dnia 26 maja 2021 r. tj. od cyklu kształcenia 2021/2022:

WIEDZA:

Absolwent zna i rozumie

W1. w stopniu zaawansowanym mechanizmy działania antybiotyków oraz lekooporności - K_W04, K_W09

W2. możliwości praktycznego zastosowania wiedzy o mechanizmach ekspresji genów w medycynie K_W02

W3. podstawowe narzędzia i zaawansowane techniki badawcze stosowane do określania lekowrażliwości i wykrywania genów oporności na antybiotyki K_W07

UMIEJĘTNOŚCI:

Absolwent potrafi

U1. Absolwent potrafi zastosować metody molekularne do wykrywania genów lekooporności i kodujących czynniki wirulencji oraz typowania szczepów K_U03

U2. ocenić zagrożenia związane z lekoopornością drobnoustrojów - K_U01, K_U02,

U3. Izolować kwasy nukleinowe z hodowli bakteryjnych, wykonać reakcje PCR oraz analizować produkty metodą elektroforezy K_U04;

U4. Absolwent potrafi dokumentować i analizować wyniki oraz formułować w sposób prawidłowy wnioski na podstawie danych uzyskanych z przeprowadzonych doświadczeń - K_U05

KOMPETENCJE SPOŁECZNE:

Absolwent jest gotów do

K1. krytycznej oceny posiadanej wiedzy i odbieranych treści w zakresie mikrobiologii - K_K01